由于果汁廢水大多呈酸性，需要對廢水的pH值進行調節，調節后可以直接使用聚丙烯酰胺進行初步的絮凝沉淀，將其中大部分的有機物、懸浮物等沉淀下去，之后再進行深度的凈化處理在其他一些處理工藝中，前期進行預處理，之后再進行絮凝沉淀，這時候選擇使用的多是陰離子聚丙烯酰胺和聚合氯化鋁。當后期污水徹底處理干凈之后，對沉淀池底部的污泥進行處理時，可以選擇加入陽離子聚丙烯酰胺進行污泥脫水，脫水之后的干泥餅可以銷往化肥廠、肥料廠、飼料廠等地方，增加收益，而處理達標的廢水可以用作灌溉、工業用水等。